开放科学的 “COVID Moonshot” 发现了可治疗 COVID-19 的新型抗病毒药物

尽管该集团的研究自 2020 年 3 月成立以来就一直向公众免费提供，但 COVID Moonshot Consortium 现在终于对其工作成果做出了正式报告。COVID Moonshot 是一项针对 SARS-CoV-2 病毒的开放科学、众包且无专利约束的新药发现运动；它已收获了大量的有关该病毒主要蛋白酶的数据，其中包括可为新型或更好药物开发做好准备的知识见解。Brian Shoichet 和 Charles Craik 在相关的《视角》中写道：“考虑到药物批准的时间表和有关挑战，[由这些研究人员]描述的主要疗法可能无法为改变当前的大流行做好及时的准备。尽管如此，这些化合物和用于确认它们的方法很可能会对未来人类的健康产生影响。”这项新颖的合作包括来自 25 个国家的跨越 47 个学术和行业组织的 200 多名科学家志愿者。Melissa Boby 等人写道：“COVID Moonshot 为开放性药物发现科学（可促进传染病药物发现的进展）提供了一个实例，这是一个对公众具有重大意义的研究领域，但后者长期以来未获来自私营部门的充足资金。”由于 SARS-CoVB-2 主要蛋白酶 (Mpro) 在病毒复制中所起的重要作用，Mpro是抗病毒药物开发的一个具有吸引力的目标。目前用于抑制 SARS-CoV-2 Mpro 的制剂——如从现有抗病毒药物体系中获取的 Paxlovid 和 Xocova 等药物——已在临床上取得了成功。然而，这些化合物的使用仍然相对有限，并且它们的肽模拟物和共价支架给合成和施用带来了问题。Boby 等人在此描述了一种新型的、非共价、非肽类抑制剂支架的发现，后者在化学结构上与现有的 Mpro 抑制剂不同。Boby 等人利用众包法和全球数百人的综合性专业知识描述他们的开放科学药物发现战役，后者涵盖了用以组装 SARS-CoV-2 主要蛋白酶及其生化活性详细结构图的机器学习、分子模拟以及高通量结构生物学和化学。在 COVID Moonshot Consortium 推出的 1 万 8000 多种化合物设计中，作者确认了几种非共价、非拟肽类抑制剂，其中包括一种具有良好生物利用度、安全性和抗病毒活性的先导化合物。该项目的所有化合物设计均可公开共享；这为将来的抗冠状病毒药物发现创建了一个内容丰富、可开放获取且不受知识产权约束的知识宝库。