神戸大学大学院保健学研究科の博士課程前期課程2年生の谷本啓(指導教官:重村克巳 准教授)らと神戸常盤大学保健科学部の大澤佳代教授、台北医学大学のFang Shiuh-Bin准教授らの研究グループは、日本の感染症患者より検出された、感染症治療に使用するβラクタム系抗菌薬の効果が乏しい基質拡張型βラクタマーゼ (ESBL)産生肺炎桿菌の解析において、従来よりも高い粘性をもつ肺炎桿菌 (過粘稠性株) では病原性に関わる遺伝子の保有率が高く、さらに薬剤が効果を示さないものが多いことを発見しました。今後、日本での過粘稠性株に対する適切かつ迅速な治療方法の確立など、臨床への応用が期待されます。
この研究成果は、8月20日に、Journal of Microbiology, Immunology and Infection (Impact Factor:10.273) にオンライン掲載されました。
ポイント
- 日本の過粘稠性肺炎桿菌は、従来の細菌株より病原性遺伝子保有率が高く、薬剤耐性を示すものが多かった。
- CTX-M-15型のESBL産生遺伝子を持つ細菌株が最も多く、FII型プラスミドがその遺伝子の拡散に関与する可能性が示唆された。
研究の背景
肺炎桿菌は尿路感染症や呼吸器感染症をひきおこす細菌です。その中でも、従来よりも高い粘性を示す肺炎桿菌 (過粘稠性株) は重症化や致命的疾患につながるリスクが高いことが報告されています。
以前は、過粘稠性株に対しては感染症患者に使用するほとんどの治療薬剤 (抗菌薬) が有効でした。しかし近年は、基質拡張型βラクタマーゼ (ESBL) という、薬剤を分解し無効化する酵素を産生する過粘稠性株などが確認されており、高い重症化リスクに加えて、これまで使用されていた薬剤が効かなくなってきており問題となっています。
さらに、ESBL産生に関わる遺伝子はプラスミドというDNAによって菌体から異なる菌体へ受け渡され広がり、次々と薬剤が効かなくなってしまうため、地域や年代ごとにその特徴や変化を監視する必要があります。しかし、日本では、過粘稠性株について十分な調査がされていません。そこで本研究では、日本の患者から検出されたESBL産生肺炎桿菌の、過粘稠性株と粘性の高くない従来の肺炎桿菌 (非過粘稠性株) を対象にして、それぞれへの薬剤の効果、薬剤の無効化 (薬剤耐性) や病原性に関わる遺伝子の保有率、それぞれの菌株が持つプラスミドの種類を比較調査しました。
研究の内容
2012年から2018年に日本の感染症患者から検出されたESBL産生肺炎桿菌291株のうち、過粘稠性株54株および非過粘稠性株53株の計107株を対象として、治療薬剤の効果、薬剤耐性や病原性に関わる遺伝子、およびプラスミド型を調べました。
対象とした過粘稠性株のほとんどが、病原性に関わる遺伝子を保有しており、非過粘稠性株と比較して保有率が高いことがわかりました (図1)。過粘稠性がより多くの高病原性因子を持っていると考えられます。また、肺炎桿菌の莢膜血清型は菌体の粘性に関与します。本研究の過粘稠性株では莢膜血清型がK2型 (40.2%) であるものが最も多く、過去の調査でもK2型の過粘稠性株が多く報告されていることから、K2型の肺炎桿菌が過粘稠性およびそれに伴う高病原性を示す可能性が高いことが考えられます。
また、対象株への薬剤の効果を判定したところ、βラクタム系抗菌薬である「セフェピム」 (14.8% vs. 43.4%、p = 0.005)と、βラクタム系抗菌薬とESBLの作用を阻害する薬剤を組み合わせた「ピペラシリン・タゾバクタム」 (70.4% vs. 92.5%、p = 0.001) の過粘稠性株に対する効果 (感性率) が非過粘稠性株より乏しいことが確認されました (図2)。これは、過粘稠性株が非過粘稠性株と比較して高頻度で薬剤耐性を獲得している (薬剤が効かなくなっている) ことを示唆しています。
さらに、薬剤耐性の要因となるESBLの産生に関わる遺伝子の保有状況を調査したところ、過粘稠性株、非過粘稠性株ともにCTX-M-15型と呼ばれるESBL産生遺伝子の保有率が最も高く(75.9%、60.4%) (図3)、同遺伝子保有株の主要なプラスミド型はFII型と呼ばれるものでした (52.1%)。他国の研究でもCTX-M-15型ESBL産生遺伝子を持つ肺炎桿菌が多く報告されており、本邦でも同遺伝子を持つ株が増加傾向にあります。
以上の結果より、過粘稠性株の高い病原性遺伝子保有率および高頻度の薬剤耐性が示されました。また、ESBL産生遺伝子型はCTX-M-15型が最も多く、FII型プラスミドがCTX-M-15遺伝子の拡散に関与している可能性が示唆されました。
今後の展開
過粘稠性を示す肺炎桿菌は重症化リスクが高いため迅速な治療が必要となります。また、治療薬剤が細菌に効かなくなる最も大きな要因は、薬剤の不適切な投与です。過粘稠性株の治療においては、薬剤耐性の状況を正確に把握し、「適切な」治療薬を「迅速に」選択することが最も重要です。
本研究の結果は、日本の過粘稠性肺炎桿菌は従来の非過粘稠性株よりも病原性遺伝子の保有率が高く、治療薬剤の効果が乏しいことを報告しており、日本の医療現場における過粘稠性株の適切かつ迅速な治療に大きく貢献することが期待されます。
また、今後さらに過粘稠性株の重症化機構や薬剤耐性機構を調査することで、新たな治療方法の確立などが期待できます。
謝辞
本研究は、下記の助成を受けて実施したものです。
- JSPS科研費:19K09670、21K10423、22K09525
論文情報
タイトル:
“Comparative genetic analysis of the antimicrobial susceptibilities and virulence of hypermucoviscous and non-hypermucoviscous ESBL-producing Klebsiella pneumoniae in Japan”
DOI:10.1016/j.jmii.2022.08.010
著者:
Hiroshi Tanimoto, Katsumi Shigemura, Kayo Osawa, Mitsuki Kado, Reo Onishi, Shiuh-Bin Fang, Shian-Ying Sung, Takayuki Miyara, Masato Fujisawa
掲載誌:
Journal of Microbiology, Immunology and Infection
Journal
Journal of Microbiology Immunology and Infection
Method of Research
Data/statistical analysis
Subject of Research
Not applicable
Article Title
Comparative genetic analysis of the antimicrobial susceptibilities and virulence of hypermucoviscous and non-hypermucoviscous ESBL-producing Klebsiella pneumoniae in Japan
Article Publication Date
20-Aug-2022
COI Statement
The authors declare no conflict of interest. The funders had no role in the design of the study, in the collection, analyses, or interpretation of data, in the writing of the manuscript, or in the decision to publish the results.