一部の腸内細菌は、ヒト宿主と進化の歴史を共有している

腸内細菌叢の数十の細菌種に含まれる株が、地球上に広まるときにヒト集団と共多様化したことが、新しい研究で示された。この知見は、マイクロバイオームを介した疾患および微生物叢に基づく治療において、集団特異的な微生物株の潜在的役割を理解することの重要性を強調している。ヒト腸内マイクロバイオームには数百種類の細菌が含まれており、よくみられる種の多くは世界中の人々に存在する。しかし、微生物種の中には、特定のヒト集団の間で顕著な遺伝的多様性を示すものもある。この系統レベルの多様性が、ヒトとその共生微生物に共通した進化史を通じて生じたものかどうかは、完全には解明されていない。共多様化を検証するため、Taichi Suzukiらは、欧州、アジア、アフリカに住む1225名の腸メタゲノムとヒトゲノムのペアを評価した。その結果、国間および国内において、ヒトの系統発生と並行した進化史を有し共多様化が示唆される60の微生物株が発見された。Suzukiらは、最も強い共多様化を示す種は、酸素および温度不耐性やゲノムの減少などの宿主依存性を示す独立して進化した形質を持つことも明らかにした。「［この研究の］結果は、腸内細菌コミュニティが、偶発的な細菌の集団ではなく、ヒト集団の異なる祖先系統を反映したものであることを示している」と、関連するPerspectiveでAndrew Moellerは述べている。「Suzukiらによって明らかにされた共多様化の歴史によって、ヒトの健康のために細菌叢を回復させる取り組みに関する情報が得られるかどうかを探索することは価値がある。」