据相关《视角》披露，在一个“堪称杰作的疫情的基因调查中”，科学家们揭示了近来在巴西的黄热病疫情是如何起源于森林中的非人类灵长动物并传染给人群的。这项研究还展示了对传染病暴发进行实时监控的各种技术能力，这对发展反制措施至关重要。尽管有针对黄热病的有效疫苗，但黄热病毒仍然会在每年导致南美与非洲2.9万-6万人死亡。巴西最近经历了其几十年来有记录的最大规模的黄热病疫情；在2016年12月至2018年3月间，确诊的病例已经超过2000人，其中有676人死亡。为了解这一疫情是如何发生的，Nuno Faria等对该地区的流行病学数据及空间和基因组数据进行了分析。他们首先对在人类和非人类灵长动物（NHPs）中确诊病例出现的时序进行了比较后发现，人类病例出现的时间要比NHPs病例出现的时间滞后4天。他们同时发现，在林区生活或工作的人感染黄热病的风险最大，因为那里通常只叮咬NHPs的蚊虫可能偶尔会叮咬人类并将黄热病毒传播给人。结果十分引人注目：在疫情爆发源附近，85%的病例为男性，因为他们比女性更可能深入遥远的丛林地带。研究人员还在巴西疫情最严重的州内对62例感染患者和NHPs的黄热病毒基因组进行了测序，并将它们与先前发表的黄热病毒基因组进行比对。数据提示，2017年的黄热病疫情很可能是由从某流行地区引入的一个病毒株引起的；该流行地区可能在巴西的北部或中西部，而非米纳斯吉拉斯州（Minas Gerais）的一个重新出现的黄热病毒世系的持续性疫区。作者说，尽管该流行病可能源自NHPs，但其病毒的传播似乎得到人类活动的助力，例如，通过汽车输送受到病毒感染的蚊虫，或通过NHPs的非法贸易来传播疫情。Alan Barrett在相关的《视角》中重点介绍了这些发现，他讨论了为疾病暴发建模对研发反制性公共卫生措施的价值。
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