image: A bigeye belonging to the hyper-diverse group Eupercaria with more than 10,000 species. view more
Credit: Image courtesy of Ricardo Betancur-R.
科研人员报告了一个扩展的鱼类基因组数据库以及一组遗传标记物，用于解析鱼类进化亲缘关系。辐鳍鱼构成了鱼类多样性的最大部分，但是基因组数据的缺乏妨碍了对于鱼类各目的进化亲缘关系的理解。Lily C. Hughes 及其同事收集并测序了代表了鱼类全部主要世系的131个转录组，然后把这些序列加入到此前的数据中，从而编纂了一个广泛的比较基因组数据库。这组作者考虑到了全基因组加倍的效应，识别出了一组共1105个用于追踪历史上鱼类各纲的分离的外显子标记物。这些结果证实了此前认识到的深进化分离起源于2亿多年前，并且还识别出了近来的进化亲缘关系。在现存鱼类物种最丰富的群体——棘鳍类鱼之中，这组作者找到了拥有快速游动的金枪鱼的科与缓慢游动的海马的科之间的联系，还找到了在底栖的比目鱼与呼吸空气的淡水鱼之间的联系。这组作者说，这些遗传标记物可能用于进一步解析所有鱼类的进化亲缘关系。
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论文 #17-19358: "Comprehensive phylogeny of ray-finned fishes (Actinopterygii) based on transcriptomic and genomic data," 作者 Lily C. Hughes 等人
媒体联系人：Lily C. Hughes，美国乔治·华盛顿大学
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Journal
Proceedings of the National Academy of Sciences