image: AmproCode技术借助氨基酸侧链特异的偶联反应，将DNA“条码”标记到蛋白质的目标氨基酸上，结合qPCR定量放大DNA信号，实现蛋白质中特定氨基酸的“编码”与“扩增”。借助为之“量身定做“的蛋白质解析计算机程序，分析实验获得的氨基酸比例信号，即可完成对数据库中蛋白质的指认。 view more
Credit: ©《中国科学》杂志社
近日，《国家科学评论》在线发表了北京大学化学与分子工程学院、北大-清华生命联合中心陈鹏课题组与王初课题组合作的研究成果。该工作开发了一种全新的蛋白质“扩增测序”的方法（AmproCode）。
研究者借助氨基酸侧链特异的偶联反应，设计了半胱氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、天冬氨酸/谷氨酸和酪氨酸特异的DNA偶联策略，将DNA“条码”成功标记到目标氨基酸的侧链上。qPCR能定量放大DNA“条码”的信号，实现蛋白质中特定氨基酸的“编码”与“扩增”，检测限低至飞摩尔每升，比质谱和ELISA灵敏10到10000倍。同时，研究者为之“量身定做“了蛋白质解析的计算机程序，以分析qPCR定量的氨基酸比例信号，完成对数据库中蛋白质的指认。研究者实验完成了ELA、URP和Aβ三条合成的分泌组多肽的鉴定，还借助计算机模拟证明了AmproCode能够成功鉴定超过90%的人类蛋白质，并评估了不同实验参数对AmproCode性能的影响，展示了此技术的应用潜力。
不同于近些年诸多将单分子技术应用到蛋白质测序领域的尝试，AmproCode是一种将蛋白质转化为可扩增分子的突破性技术。它为下一代蛋白质测序技术的开发提供了全新的思路。
研究详情请见原文：
Amplifiable protein identification via residue-resolved barcoding and composition code counting
https://doi.org/10.1093/nsr/nwae183
Journal
National Science Review