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染色体水平的榴莲基因组揭示了祖先核型重排现象以及木质素生物合成和抗逆的分子机制

Peer-Reviewed Publication

Science China Press

染色体水平的榴莲基因组以及Ks分析确定榴莲近期的WGT事件

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Credit: ©《中国科学》杂志社

Science China Life Sciences杂志近期报道了来自陕西师范大学俞嘉宁团队和武汉大学朱玉贤团队合作完成的研究成果。这项研究组装了一个777.8 Mb的榴莲参考基因组,挂载了28条染色体并注释到了38,728个蛋白编码基因。通过该高质量的榴莲基因组,作者联合可可基因组构建了11条锦葵科植物的祖先核型,揭示了其在榴莲28条染色体中的重排现象以及演化轨迹。通过比较基因组分析,作者发现榴莲大约在20个百万年前(17至24个百万年前)经历了一次WGT事件。

作者进一步发现,扩张的WGD类型的复制基因明显富集在本丙烷合成通路中的木质素生物合成模块,这表明榴莲最近的WGD可能促进了这一特定通路的多样化,而这一通路对榴莲特有果刺的发育非常重要。HSF家族和HSP家族的扩张,可能增强了榴莲的耐热性。

研究详情请见原文:

Upgraded durian genome reveals the role of chromosome reshuffling during ancestral karyotype evolution, lignin biosynthesis regulation, and stress tolerance

https://link.springer.com/article/10.1007/s11427-024-2580-3


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