Para comprender mejor la propagación del COVID-19 durante la pandemia, los funcionarios de salud pública ampliaron la vigilancia de las aguas residuales. Estos esfuerzos rastrean los niveles de SARS-CoV-2 y los riesgos para la salud entre la mayoría de las personas, pero no incluyen a las personas sin hogar, una población especialmente vulnerable a infecciones graves. Para llenar esta brecha de información, los investigadores que publican en la revista Environmental Science & Technology Letters de ACS realizaron pruebas en vías fluviales de control de inundaciones cercanas a campamentos de personas sin hogar y descubrieron patrones de transmisión similares a los de la comunidad en general e identificaron mutaciones virales nunca antes vistas.
En los últimos años, el análisis de las aguas residuales no tratadas para determinar la incidencia del SARS-CoV-2 y las variantes virales dominantes, así como otros patógenos, ha sido vital para ayudar a los funcionarios de salud pública a determinar la transmisión de enfermedades infecciosas en las comunidades locales. Sin embargo, este monitoreo solo recoge información sobre los virus diseminados a partir de las heces y orina humana en edificios que están conectados a la infraestructura de alcantarillado local. Más allá del impacto de la pandemia en la salud humana, también exacerbó las dificultades socioeconómicas y aumentó el número de personas que viven sin hogar y en campamentos al aire libre sin acceso a baños interiores. Para comprender la prevalencia de la COVID-19 entre las personas sin hogar, Edwin Oh y sus colegas realizaron pruebas de detección de SARS-CoV-2 en vías fluviales cerca de campamentos en las afueras de Las Vegas desde diciembre de 2021 hasta julio de 2022.
Mediante la reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa, los investigadores identificaron el ARN de SARS-CoV-2 en más del 25 % de las muestras analizadas a partir de dos canales de control de inundaciones. La mayor frecuencia de detección durante el período de estudio coincidió con la primera oleada de infecciones por la variante ómicron en Las Vegas, según se confirmó a través de pruebas paralelas en una planta local de tratamiento de aguas residuales. Los investigadores afirman que estos resultados sugieren que se estaba produciendo un nivel similar de transmisión dentro de la comunidad de personas sin hogar como entre la población general. Luego, los investigadores llevaron a cabo la secuenciación del genoma completo para identificar las variantes del SARS-CoV-2 en las vías fluviales. Estas muestras contenían, en gran medida, las mismas variantes identificadas en la comunidad en general. Un análisis computacional más profundo de las secuencias virales identificó tres nuevas mutaciones de la proteína de espícula del virus en algunas muestras de vías fluviales, pero los investigadores aún no han examinado el impacto que estas mutaciones podrían tener en la función viral o en los resultados clínicos. No obstante, la capacidad de detectar e identificar el SARS-CoV-2 en muestras de agua ambiental podría ayudar a mejorar las medidas de salud pública para una comunidad que a menudo está poco representada en los métodos de vigilancia actuales. Los investigadores también afirman que el monitoreo de las vías fluviales podría advertir a los funcionarios de salud sobre variantes inesperadas que circulan en la comunidad.
Los autores agradecen la financiación de los Institutos Nacionales de Salud, la Oficina de Desarrollo Económico del Gobernador de Nevada, los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades y el Instituto de Investigación de Recursos Hídricos del Servicio Geológico de los Estados Unidos.
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Journal
Environmental Science & Technology Letters
Article Title
Environmental Surveillance of Flood Control Infrastructure Impacted by Unsheltered Individuals Leads to the Detection of SARS-CoV‑2 and Novel Mutations in the Spike Gene
Article Publication Date
3-Apr-2024