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探索蛋白质相分离,英矽智能与剑桥大学发现阿尔茨海默氏症和其他疾病靶点识别的新方法

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InSilico Medicine

剑桥大学Vendruscolo博士实验室研究组

image: 剑桥大学化学系错误折叠疾病中心副主任Michele Vendruscolo教授领导的一组研究人员与英矽智能的科学家合作,利用英矽智能人工智能平台推进了一种利用蛋白质相分离鉴定疾病靶点的新方法。 view more 

Credit: Christine Lim

最新研究表明,蛋白质相分离(PPS)广泛存在于细胞中,并驱动着各种重要的生物学功能。在错误的地点或时间发生相分离,可能会造成与神经退行性疾病相关的分子堵塞或聚集,不良的细胞凝聚物也可能会导致癌症,并有助于解释衰老过程。

 

鉴于人类疾病与蛋白质相分离过程的关联性,确定基于蛋白质相分离调控的潜在治疗靶点备受关注。今天,由人工智能(AI)驱动临床阶段生物医药科技公司英矽智能与剑桥大学在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上联合发表了一篇论文,介绍了一种方法识别与蛋白质相分离相关的人类疾病靶点。值得一提的是,这是自 2021 年 9 月双方达成合作以来取得的一个重要研究里程碑。

 

在这项研究中,研究人员将英矽智能自主研发的靶点识别引擎PandaOmics 与 FuzDrop 相结合,用于识别与蛋白质相分离易感疾病相关的蛋白。 PandaOmics 是一种人工智能驱动的靶点发现工具,它整合了多种组学样本、文本数据以及人工智能生物信息学模型,以评估蛋白质作为治疗靶点的潜力。FuzDrop 是剑桥大学 Michele Vendruscolo 教授小组推出的一种开创性工具,它可以计算蛋白质自发现分离的倾向,从而帮助识别易形成液相分离凝聚物的蛋白质。

 

利用这种方法,研究人员对人类样本数据进行了大规模的多组学研究,量化了蛋白质相分离在调控与疾病相关的各种病理过程中的影响,对具有较高 PandaOmics和FuzDrop评分的候选蛋白进行优先排序,并生成了与蛋白质相分离过程失调相关的潜在疾病靶点列表。

 

此外,研究人员还在两个阿尔茨海默症细胞模型中验证了这种方法下预测的三个靶点(MARCKS、CAMKK2和p62)的不同相分离行为,这为这些预测靶点参与阿尔茨海默症提供了实验验证,并支持它们作为治疗靶点的进一步开发潜力。通过调节这些凝聚物的形成和行为,有望开发出新颖的干预措施,来减轻与阿尔茨海默症相关的病理过程。

 

论文共同作者、英矽智能香港团队负责人潘颖博士表示,"我们很高兴与剑桥大学的合作取得了阶段性成果。这项研究旨在为靶向蛋白相分离易感疾病相关蛋白提供初步方向。随着研究蛋白质相分离过程的技术不断进步,以及有关其在细胞功能和功能障碍中作用的数据日益增多,我们将有机会进一步了解蛋白质相分离过程中的靶点与疾病发生的因果关系。我们期待着在不久的将来把这项临床前研究转化为新型治疗干预措施。”

 

剑桥大学化学系错误折叠疾病中心副主任Michele Vendruscolo教授表示, “迄今为止,了解蛋白质相分离在细胞功能中的作用一直是一项挑战。更困难的是弄清它与人类疾病的确切相关性。通过与 英矽智能合作,我们开发出了一种多组学方法来系统地解决这一问题,并确定多种可能的治疗干预靶点。为研究人员探索这一复杂领域提供了指导工具。”

 

关于英矽智能

英矽智能是一家由生成式人工智能驱动的生物医药科技公司,通过下一代人工智能系统连接生物学、化学和临床试验分析,利用深度生成模型、强化学习、转换模型等现代机器学习技术,构建强大且高效的人工智能药物研发平台,识别全新靶点并生成具有特定属性分子结构的候选药物。英矽智能聚焦癌症、纤维化、免疫、中枢神经系统疾病、衰老相关疾病等未被满足医疗需求领域,推进并加速创新药物研发。

 

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